曲龙寺是格鲁派的早期寺院之一，1393年，36岁的格鲁派创始人宗喀巴大师“率同师徒弟子共九人赴沃卡却隆静修”宣传格鲁派教法。当时沃卡宗的宗本扎西伦珠因笃信佛教，自愿作了这师徒九人的施主。宗本极力要求为这九名在岩洞中修行的师徒修建一座道场。于是在宗喀大师的应允旨意下修了一座长14肘，宽11肘的经堂，直到1969年这座经堂依然如故，这就是曲龙寺初建的情况。
以后“大师拜三十五佛忏,手足指皆已破裂，石上磨成手足和头部迹印。复在一个比较大点的而根也很稳固的四方石盘上作曼荼罗供，以腕部磨试，两腕皆伤，把石磨转得很平滑”。这两块石头就由他的弟子供奉于寺院之内，至今遗迹仍在，成为该寺的镇寺之宝。从此以后宗喀巴大师以曲龙寺为落脚点，在沃卡一带传授格鲁派教法。
